Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N5

Nxph4, Neurexophilin, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxph4G3X9N5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nxph4G3X9N5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nxph4G3X9N5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms