Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm16519F8VQK7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16519F8VQK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms