Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Speer4aF8VPX6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4aF8VPX6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms