Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Farp1F8VPU2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Farp1F8VPU2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms