Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid4aF8VPQ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid4aF8VPQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms