Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M1F7CXU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M1F7CXU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms