Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
D430041D05RikF6ZGR6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
D430041D05RikF6ZGR6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms