Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm10563F6WIE4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10563F6WIE4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm10563F6WIE4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms