Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21974F6W3F3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21974F6W3F3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms