Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngap1F6SEU4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngap1F6SEU4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms