Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm340F6RGI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms