Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Taf4E9QAP7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf4E9QAP7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Taf4E9QAP7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4E9QAP7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms