Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms