Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700113H08RikE9Q9Q5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms