Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430401F13RikE9Q328 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms