Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2H5

Gm3233, Predicted gene 3233, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3233E9Q2H5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3233E9Q2H5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3233E9Q2H5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms