Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Abcc4E9Q236 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc4E9Q236 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms