Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lrp3E9Q1T6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrp3E9Q1T6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrp3E9Q1T6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrp3E9Q1T6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrp3E9Q1T6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms