Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3893E9Q1I1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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