Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt78E9Q0F0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms