Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5415E9PXF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms