Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4931408C20RikE9PWP9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms