Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC035044E0CXF8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms