Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms