Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930407I10RikD3Z5T8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4930407I10RikD3Z5T8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930407I10RikD3Z5T8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms