Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed7D3YZZ5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed7D3YZZ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms