Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc6D3YZP9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc6D3YZP9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms