Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad1D3YYZ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad1D3YYZ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms