Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm42791D3YYB5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm42791D3YYB5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms