Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif28pD3YXS5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms