Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms