Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms