Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms