Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc5C3VPR6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc5C3VPR6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrc5C3VPR6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms