Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Cspp1B2RX88 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cspp1B2RX88 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms