Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf3B2RUQ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms