Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NhsB1AV60 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NhsB1AV60 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NhsB1AV60 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NhsB1AV60 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NhsB1AV60 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NhsB1AV60 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NhsB1AV60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NhsB1AV60 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NhsB1AV60 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms