Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms