Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
1700084M14RikB1AT01 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700084M14RikB1AT01 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms