Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms