Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp36B1AQJ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms