Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-M5A7VMS3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms