Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skor2A7M7C7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor2A7M7C7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms