Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms