Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll6A4Q9E8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll6A4Q9E8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms