Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttll2A4Q9E4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttll2A4Q9E4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll2A4Q9E4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms