Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4931406B18RikA2RSL7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms