Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms