Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1jA2BFR3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1jA2BFR3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms