Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fibcd1A2AV25 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fibcd1A2AV25 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fibcd1A2AV25 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fibcd1A2AV25 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fibcd1A2AV25 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fibcd1A2AV25 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms